Putovanje avionom može predstavljati rizik za osobe s određenim zdravstvenim stanjima, jer promjene pritiska, niži nivo kisika i ograničeno kretanje tokom leta mogu pogoršati postojeće tegobe.
Avio-kompanije imaju pravo raspitati se o zdravstvenom stanju putnika i, u pojedinim slučajevima, uskratiti ukrcavanje ako procijene da postoji rizik po sigurnost putnika ili drugih osoba u avionu. To se odnosi na putnike pod uticajem alkohola, sa zaraznim bolestima, kao i na one sa ozbiljnim srčanim, plućnim ili drugim zdravstvenim problemima.
Posebno rizična stanja uključuju nestabilne srčane i plućne bolesti, nedavne operacije (zbog mogućnosti širenja vazduha u tijelu), gipsane imobilizacije, te trudnoću nakon 28. sedmice.
Osobe koje boluju od Parkinsonove bolesti mogu putovati avionom, ali se preporučuje da o svom stanju obavijeste kabinsko osoblje kako bi im po potrebi omogućilo tečnost i dodatnu podršku tokom leta.
Također, avio-osoblje može odbiti ukrcavanje putnicima s vidljivim simptomima bolesti, poput upornog kašlja, povraćanja, proliva ili gripe, radi zaštite zdravlja ostalih putnika.